resessiiviset viat
| geenin nimi | kuvaus | geeni & Ilmaisukoodi |
| BLAD | naudan leukosyyttien Adheesiopuutos (normaalisti esiintyvän proteiinin puutos, jota tarvitaan veren valkosoluissa tai leukosyyteissä, jotka ovat elimistön infektiotaistelijoita) | BLC = testattu blad: n kantaja BLF = testattu BLAD: n kantaja |
| Muulijalka | Muulijalka (jalkaterän varpaat on yhdistetty, jolloin eläimellä on yksi sorkka sorkkien sijaan ones) | MFC = muulin jalan testattu kantaja MFF = muulin jalan testattu kantaja |
| kaatopaikat | Uridiinimonofosfaattisyntaasin puutos (yksi monista normaalia metaboliaa edistävistä entsyymeistä) | DPC = testatut kaatopaikkojen kantajat DPF = testatut kaatopaikkojen kantajat |
| CVM | monimutkainen Nikamaepämuodostuma (aiheuttaa kuolleena syntyneitä vasikoita, keskenmenoja ja varhaisia alkion menetyksiä) | CVC = CVM: n testattu kantaja CVF = CVM: n ei-kantaja |
| tekijä X1 | Tekijä X1 (veren hyytymishäiriö) | XIC = hyytymistekijän X1 testattu kantaja XIF = testattu hyytymistekijän X1 kantaja |
| CIT | Sitrullinemia (ammoniakin ja muiden toksisten aineiden kertyminen vereen nuorilla vasikoilla) | CNC = testattu Sitrullinemian kantaja CNF = testattu Sitrullinemian kantaja |
| Brachyspina | Brachyspina (aiheuttaa abortin ja kuolleena syntyneen, lyhentyneen selkäytimen, pitkät jalat ja epänormaalit elimet) | BYC = Brachyspinan testattu kantaja BYF = Brachyspinan testattu kantaja |
| CD (suora testi) | Kolesterolipuutos, vasikoiden kolesteroli on alentunut tai ei ole alentunut, mikä on johtanut kuolemaan nuorena | CDF = testattu ei-kantaja / vapaa kolesterolipuutoksesta CDC = testattu kolesterolipuutoksen kantaja (heterotsygoottinen) CDS = testattu kolesterolipuutoksen todellinen kantaja (homotsygoottinen)) |
haastateltu tila
| haastateltu Status | geeni | geeni & Lausekekoodi |
| haastateltu (epäsuora testi) | epäsuora testi | POS= testattu todenmukainen haastateltu (homotsygoottinen PP) POC = testattu haastateltu kantaja (heterotsygoottinen Pp) POF= testattu vapaa haastatelluista |
punaiset alleelit
| turkin väri | geeni | geeni & Ilmaisukoodi |
| punainen | Punainen geeni (MCR1) | RDC = punaisen geenin kantaja RDF = testattu ei-punaisen geenin kantaja |
| punainen | variantti Punainen geeni | VRR = ei testattu/määritetty perimän mukaan. VRS = testattu tosi (homotsygoottinen) *Sisältää BKC-koodin. VRC = testattu kantaja (heterotsygootti) VRF = testattu vapaa. |
| musta / punainen | Musta / punainen geeni (MCR1) | BRC = mustan / punaisen geenin kantaja |
| musta | Musta geeni (MCR1) | BKC = mustan geenin kantaja |
maitoproteiinit
| maitoproteiinit | geeni | geeni & Ilmaisukoodi |
| Beetakaseiini (A2) | CSN2 | a1a1 = homotsygoottinen A1-alleelin osalta a1a2 = heterotsygoottinen A1: n ja A2: n osalta a2a2 = homotsygoottinen A2: n osalta |
| Kappa-kaseiini | CSN2 | KCAA = homotsygootti A-alleelille kcab = heterotsygootti A: lle & B KCBB = homotsygootti B: lle kcac = heterotsygootti A: lle & C kcae = heterotsygootti A: lle & C kcae = heterotsygootti kun a & E |
alkioiden hedelmällisyyteen
vaikuttavien haplotyyppien tiedetään vaikuttavan negatiivisesti Holstein-rodun hedelmällisyyteen. Nämä ovat HH1, HH2, HH3, HH4, HH5 ja HH6. Samoin JH1-haplotyyppi on raportoitu Jerseyn roduksi, kuten on BH2 ruskeassa Sveitsissä ja AH1 ja AH2 Ayrshiresissa.
syitä haplotyyppien vaikutukseen hedelmällisyyteen ei tunneta, mutta arvellaan, että saman viallisen haplotyypin periytyminen kummaltakin vanhemmalta johtaa epäonnistuneeseen hedelmöitymiseen tai varhaiseen alkiokuolemaan.
eläimet, joilla on viallisen haplotyypin yksi versio, koodataan C: llä. esimerkiksi HH1: tä kantava eläin koodataan hh1c: llä. eläimet, joilla ei ole kopioita (eli joilla ei ole haplotyyppiä), koodataan T: llä, esimerkiksi HH1T.
HAPLOTYYPIN periytyminen
1. Jos molemmat vanhemmat ovat ei-toivotun haplotyypin (HH1C)kantajia:
on 25 prosentin mahdollisuus, että sairastunut jälkeläinen ei selviäisi syntymään asti
elävistä jälkeläisistä, kolmannes on sairastumattomia ei-kantajia ja kaksi kolmasosaa kantajia, esimerkiksi: Hh1c-lehmä (carrier = Rr) x Hh1c-lehmä (carrier = Rr) R = normaali haplotyyppi
r = HH1-haplotyyppi (joka sisältää aiheuttavan mutaation)
2. Jos emoa ei tunneta, mutta emoemo ja sonni ovat molemmat ei-toivotun haplotyypin (HH1C) kantajia: on 12,5 prosentin mahdollisuus, että syntyvä alkio ei selviä syntymään
3. Jos lehmä ja sonni olivat eri haplotyyppien kantajia, esim.jos lehmä oli HH1C ja härkä hh2c, seuraavia jälkeläisiä voidaan odottaa:
– 25% ei-kantajia molemmista (HH1T ja HH2T) )
– 25% kantajia jommastakummasta (HH1C)
– 25% kantajia toisesta (HH2C)
– 25% kantajia molemmista (hh1c ja hh2c)
JALOSTUSPÄÄTÖKSET ja hedelmällisyyden haplotyypit
paras neuvo on välttää sellaisten sonnien käyttöä, joilla on jokin näistä viallisista haplotyypeistä, koska tällaisten SIREIDEN käyttö vähentää SIKIÄMISASTETTA keskimääräisessä karjassa. Jos myös astutettaville naaraille on tehty genomitesti, voidaan käyttää kantajasonnia, jos naaras on kantajasonni. Kasvattajat eivät kuitenkaan välttämättä halua riskeerata kantajavasikan tuottamista, sillä jalostuksen taloudellinen arvo voi olla pienempi, jos kyseessä on esimerkiksi TEKOÄLYEHDOKAS-sonni.