esponjas usam principalmente produtos químicos para se proteger, e os produtos químicos são tóxicos ou apenas têm um gosto ruim. Isso não apenas impede a predação, mas também a concorrência, pois os produtos químicos que liberam impedem que outros organismos cresçam perto deles. Espécies individuais têm outras estratégias, como escavar corais, rochas ou moluscos para obter proteção. Outra estratégia que muitos corais usam para manter predadores como estrelas do mar longe é derramar pequenos pedaços de seus elementos esqueléticos, chamados espículas, no fundo do mar. Estes podem se acumular em uma camada espessa, dissuadindo predadores que devem rastejar para alcançá-los. Nem todas as esponjas têm um mecanismo de defesa direta. As esponjas de vidro não produzem toxinas, mas vivem no oceano muito profundo, onde os predadores são raros.
apesar de suas defesas, as esponjas só podem fazer pequenos movimentos, quando podem se mover. Eles são vulneráveis a quaisquer organismos que possam superar suas defesas e são presas de muitas espécies de tartarugas, peixes e invertebrados. As esponjas podem se beneficiar parcialmente da predação, no entanto, já que fragmentos de esponja deixados para trás por predadores muitas vezes podem sobreviver e se restabelecer como organismos independentes. Sua organização de nível celular extremamente simples significa que muitas vezes eles podem sobreviver até mesmo danos graves causados por predadores ou efeitos ambientais.