recessiva defekter
| Gennamn | beskrivning | Gen & Uttryckskod |
| BLAD | bovin Leukocytadhesionsbrist (brist på ett normalt förekommande protein som behövs för vita blodkroppar eller leukocyter, som är kroppens infektionskämpar) | BLC = testad bärare av BLAD BLF = testad icke-bärare av BLAD |
| Mulefot | Mulefot (tårna på foten förenas, vilket ger djuret en enda hov, istället för klöv | MFC = testad bärare av Mulefot MFF = testad icke-bärare av Mulefot |
| dumpar | brist på Uridinmonofosfatsyntas (ett av många enzymer som bidrar till normala metaboliska processer) | DPC = testad bärare av dumpar DPF = testad icke-bärare av dumpar |
| CVM | komplex Vertebral missbildning (orsakar fortfarande födda kalvar, aborter och tidiga embryonala förluster) | CVC = testad bärare av CVM CVF = testad icke-bärare av CVM |
| faktor X1 | Faktor X1 (blodkoagulationsstörning) | XIC = testad bärare av faktor X1 XIF = testad icke-bärare av faktor X1 |
| CIT | Citrullinemia (ansamling av ammoniak och andra gifter i blod hos unga kalvar) | CNC = testad bärare av Citrullinemia CNF = testad icke-bärare av Citrullinemia |
| Brachyspina | Brachyspina (orsakar abort och dödfödd, förkortad ryggmärg, långa ben och onormala organ) | BYC = testad bärare av Brachyspina BYF = testad icke-bärare av Brachyspina |
| CD (direkttest) | Kolesterolbrist, kalvar har minskat eller inget kolesterol vilket resulterar i död i ung ålder | CDF = testad icke-bärare / fri från kolesterolbrist CDC = testad bärare av kolesterolbrist (heterozygot) CDS = testad sann bärare av kolesterolbrist (homozygot) |
POLLED STATUS
| tillfrågad Status | Gen | Gen & Uttryckskod |
| Polled (nuvarande indirekt Test) | indirekt Test | POS = testad true polled (homozygot PP) POC = testad bärare av polled (heterozygot Pp) POF = testad fri från polled |
röda alleler
| pälsfärg | Gen | Gen & Uttryckskod |
| röd | röd gen (MCR1) | RDC = bärare av röd gen RDF = testad icke-bärare av röd gen |
| röd | Variant röd gen | VRR = ej testad/bestämd av härstamning. VRS = testad sann (homozygot) * inkluderar BKC-kod. VRC = testad bärare (heterozygot) VRF = testad gratis. |
| svart / röd | svart / röd gen (MCR1) | BRC = bärare av svart / röd gen |
| svart | Svart gen (MCR1) | BKC = bärare av svart gen |
mjölkproteiner
| mjölkproteiner | Gen | Gen & Uttryckskod |
| Betakasein (A2) | CSN2 | A1A1 = homozygot för A1-allelen A1A2 = heterozygot för A1 och A2 A2A2 = homozygot för A2 |
| Kappa kasein | CSN2 | KCAA = homozygot för A-allelen KCAB = heterozygot för A & B KCBB = homozygot för B KCAC = heterozygot för A & C KCAE = heterozygot för A & e |
haplotyper som påverkar embryos fertilitet
sex defekta haplotyper, identifierade via genomisk testning, är kända för att påverka fertiliteten negativt i Holsteinrasen. Dessa är HH1, HH2, HH3, HH4, HH5 och HH6. På samma sätt rapporteras JH1-haplotypen Jersey-rasen, liksom BH2 i Brown Swiss och AH1 och AH2 i Ayrshires.
orsakerna till att haplotyper påverkar fertiliteten är okända, men man tror att arv av samma defekta haplotyp från varje förälder resulterar i misslyckad befruktning eller tidig embryonal död.
djur som bär en version av en defekt haplotyp kodas med en C. Till exempel är ett djur som bär HH1 kodad HH1C. djur som inte har några kopior (dvs. fria från haplotypen) kodas med en T, till exempel HH1T.
HAPLOTYPARV
1. Om båda föräldrarna är bärare av en oönskad haplotyp (HH1C):
det finns en 25% chans att det kommer att finnas en drabbad avkomma som inte skulle överleva till födseln
av de levande avkommorna, en tredjedel kommer att vara opåverkade icke-bärare och två tredjedelar kommer att vara bärare, till exempel: HH1C Ko (bärare = Rr) x hh1c Ko (bärare = Rr) R = Normal haplotyp
r = HH1 haplotyp (innehållande den orsakande mutationen)
2. Om dammen är okänd, men grandsire och tjur är båda opåverkade bärare av en oönskad haplotyp (HH1C): det finns en 12,5% chans att det resulterande embryot inte kommer att överleva till födseln
3. Om kon och tjuren var bärare av olika haplotyper, t.ex. om Kon var HH1C och tjuren var hh2c, kunde följande resulterande avkommor förväntas:
– 25% icke-bärare av båda (HH1T och HH2T) )
– 25% bärare av en (HH1C)
– 25% bärare av den andra (HH2C)
– 25% bärare av båda (hh1c)
AVELSBESLUT och FERTILITETSHAPLOTYPER
det bästa rådet är att undvika att använda tjurar som bär någon av dessa defekta haplotyper, eftersom användning av sådana djur kommer att minska BEFRUKTNINGSGRADEN i den genomsnittliga besättningen. Om honorna som paras har också genomiskt testats, då en bärare tjur kan användas om honan är en icke-bärare. Uppfödare kanske dock inte vill riskera att producera en bärarkalv, vilket kan ha ett lägre ekonomiskt värde för avel, till exempel om det var en AI-kandidattjur.