alligatorn anpassar sig till sin miljö genom att förlita sig på sin kamouflerade hud, positionen för ögonen och näsborrarna, öronens förmåga att stänga och dess specialiserade organ. Både alligatorns lungor och hjärta är anpassade till långa perioder nedsänkt i vattnet.
en av alligatorns anpassningar för sin miljö ligger i de specialiserade lungorna och hjärtat som gör det möjligt att hålla sig säkert nedsänkt i vattnet. Lungorna skyddas av en struktur som förhindrar att vatten kommer in i dem även när munnen är öppen. Hjärtat kan separera syresatt och deoxygenerat blod och skicka det syrerika blodet till hjärnan så att alligatorn kan stanna under vattnet under långa perioder.
alligatorns ögon, näsa och öron är också anpassade till dess vattniga miljö. Både näsborrarna och ögonen ligger ovanpå huvudet så att det kan förbli nästan helt nedsänkt och fortfarande andas genom näsborrarna. När ögonen är nedsänkta skyddar ett membran dem och gör det möjligt för alligatorn att se.
en annan anpassning är Alligatorens dölja. Den grå färgen och knopparna och stötarna på kroppen gör att den kan smälta in i omgivningen, vilket ofta ger alligatorn utseendet på en stock och låter den smyga sig på byte.