recesivní defekty
| Název genu | popis | Gen & kód exprese |
| BLAD | nedostatek adheze leukocytů skotu (nedostatek normálně se vyskytujícího proteinu potřebného pro bílé krvinky nebo leukocyty, které jsou bojovníky proti infekci těla) | BLC = testovaný nosič BLAD BLF = testovaný nenosič BLAD |
| Mule Foot | Mule-Foot (prsty nohy jsou spojeny, dává zvíře jediné kopyto, místo spárkaté | MFC = testovaný nosič nohy mezka MFF = testovaný nosič nohy mezka |
| skládky | nedostatek Uridinmonofosfátsyntázy (jeden z mnoha enzymů přispívajících k normálním metabolickým procesům) | DPC = testovaný nosič skládek DPF = testovaný nenosič skládek |
| CVM | komplexní vertebrální malformace (způsobuje dosud narozená telata, potraty a časné embryonální ztráty) | CVC = testovaný nosič CVM CVF = testovaný nenosič CVM |
| faktor X1 | Faktor X1 (porucha srážení krve) | XIC = testovaný nosič faktoru X1 XIF = testovaný nenosič faktoru X1 |
| CIT | Citrulinémie (akumulace amoniaku a dalších toxických látek v krvi u mladých telat) | CNC = testovaný nosič Citrulinémie CNF = testovaný nenosič Citrulinémie |
| Brachyspina | Brachyspina (způsobuje potrat a mrtvě narozené, zkrácenou míchu, dlouhé nohy a abnormální orgány) | BYC = testovaný nosič Brachyspiny BYF = testovaný nenosič Brachyspiny |
| CD (přímý test) | nedostatek cholesterolu , telata mají snížený nebo žádný cholesterol, což vede k úmrtí v mladém věku | CDF = testovaný nosič / bez nedostatku cholesterolu CDC = testovaný nosič nedostatku cholesterolu (heterozygotní) CDS = testovaný pravý nosič nedostatku cholesterolu (homozygotní)) |
dotázaný stav
| stav dotazovaných | Gen | Gen & kód exprese |
| dotazovaný (aktuální nepřímý Test) | nepřímý Test | POS= testováno pravda dotázaných (homozygotní PP) POC = testovaný nosič dotázaných (heterozygotní Pp) POF= testováno bez dotázaných |
červené alely
| barva srsti | Gen | Gen & kód exprese |
| červená | červený Gen (MCR1) | RDC = nosič červeného genu RDF = testovaný nenosič červeného genu |
| červená | varianta červeného genu | VRR = netestováno / určeno podle linie. VRS = tested true (homozygotní) *obsahuje kód BKC. VRC = testovaný nosič (heterozygotní) VRF = testováno zdarma. |
| černá / červená | černá / červená Gen (MCR1) | BRC = nosič černé / červené genu |
| Černá | černý Gen (MCR1) | BKC = nosič černého genu |
mléčné bílkoviny
| mléčné proteiny | Gen | Gen & kód exprese |
| Beta Kasein (A2) | CSN2 | A1A1 = homozygotní pro alelu A1 A1A2 = heterozygotní pro A1 a A2 A2A2 = homozygotní pro A2 |
| Kappa kasein | CSN2 | KCAA = homozygotní pro alelu a KCAB = heterozygotní pro A & B KCBB = homozygotní pro B KCAC = heterozygotní pro A & C KCAE = heterozygotní pro A & E |
haplotypy ovlivňující plodnost embryí
šest defektních haplotypů identifikovaných genomickým testováním negativně ovlivňuje plodnost holštýnského plemene. Jedná se o HH1, HH2, HH3, HH4, HH5 a HH6. Podobně, haplotyp JH1 je hlášen u plemene Jersey, stejně jako BH2 u hnědého Švýcarska a AH1 a AH2 v Ayrshires.
důvody, proč haplotypy ovlivňují plodnost, nejsou známy, předpokládá se však, že dědičnost stejného defektního haplotypu od každého rodiče vede k neúspěšnému početí nebo časné embryonální smrti.
Zvířata nesoucí jednu verzi vadného haplotypu jsou kódována C. například zvíře nesoucí HH1 je kódováno HH1C. Zvířata identifikovaná jako bez kopií (tj. bez haplotypu) jsou kódována T, například HH1T.
dědičnost haplotypu
1. Pokud jsou oba rodiče nositeli nežádoucího haplotypu (HH1C):
existuje 25% šance, že bude postižený potomek, který by nepřežil narození
živého potomka, jedna třetina bude nedotčena nenosiči a dvě třetiny budou přenašeči, například: kráva Hh1c (nosič = Rr) x kráva HH1C (nosič = Rr) R = normální haplotyp
r = haplotyp HH1 (obsahující příčinnou mutaci)
2. Pokud je přehrada neznámá, ale grandsire i Býk jsou neovlivněnými nositeli nežádoucího haplotypu (HH1C): existuje 12,5% šance, že výsledné embryo nepřežije do narození
3. Pokud byla kráva a býk nositeli různých haplotypů, např. pokud byla kráva HH1C a býk byl HH2C, lze očekávat následující výsledné potomstvo:
– 25% nenosičů obou (HH1T a HH2T) )
-25% nosičů jednoho (HH1C)
– 25% nosičů druhého (HH2C)
– 25% nosičů obou (HH1C a HH2C)
chov rozhodnutí a plodnost haplotypů
nejlepší radou je vyhnout se použití býků, kteří nesou některý z těchto vadných haplotypů, protože použití takových sourozenců sníží početí v průměrném stádu. Pokud byly samice, které jsou pářeny, také genomicky testovány, lze použít nosného býka, pokud je samice nenosičem. Chovatelé však nemusí chtít riskovat produkci nosného tele, které může mít nižší finanční hodnotu pro chov, například pokud se jednalo o kandidáta na býka AI.