aligátor se přizpůsobuje svému prostředí tím, že se spoléhá na svou maskovanou kůži, polohu očí a nosních dírek, schopnost uší zavřít a specializované orgány. Aligátorovy plíce i srdce jsou přizpůsobeny dlouhým časům stráveným ponořeným ve vodě.
jedna z adaptací aligátora pro jeho životní prostředí spočívá ve specializovaných plicích a srdci, které mu umožňují bezpečně zůstat ponořený ve vodě. Plíce jsou střeženy strukturou, která zabraňuje vniknutí vody do nich, i když jsou ústa otevřená. Srdce je schopno oddělit okysličenou a deoxygenovanou krev a poslat krev bohatou na kyslík do mozku, aby aligátor mohl zůstat pod vodou po dlouhou dobu.
oči, nos a uši aligátora jsou také přizpůsobeny jeho vodnatému prostředí. Jeho nosní dírky i oči jsou umístěny na hlavě, takže mohou zůstat téměř úplně ponořeny a stále dýchat nosními dírkami. Když jsou oči ponořeny, membrána je chrání a umožňuje aligátorovi vidět.
další adaptací je aligátorova kůže. Šedé zbarvení a knoflíky a hrboly na těle mu umožňují splynout s okolím, často dávají aligátorovi vzhled polena a umožňují mu vplížit se na kořist.