Janovo evangelium vyniká z prvních tří evangelií, Matouše, Marka a Lukáše. Tato tři evangelia, které se nazývají synoptická evangelia, jsou si navzájem velmi podobné ve srovnání s Janovým evangeliem. Témata v Johnovi vynikají na rozdíl od témat v jiných raně křesťanských spisech. John říká, že Ježíš je Boží slovo, které se nenachází v žádném jiném evangeliu, spolu s tím, že ho nazývá stvořitelem vesmíru. Většina příběhů nalezených v Johnovi je pro Johna jedinečná a nikde jinde ji nenajdete. Slova a skutky zaznamenané v Johnovi se vyskytují pouze v Johnovi. Například, příběh Ježíše, který mění vodu na víno, se vyskytuje pouze v Janově evangeliu, spolu s Ježíšem, který vzkřísil Lazara z mrtvých. Dlouhé diskurzy a dialogy, včetně dialogu s Nikodémem, jsou pro Johna jedinečné. V Janovi není tolik zázraků, ale ty, které jsou v něm, jsou mnohem velkolepější než ty v jakémkoli jiném evangeliu. Neexistuje ani žádné mesiánské tajemství. Ježíš neskrývá své schopnosti. Chce ukázat, kdo je.
Jan vykresluje Ježíše jako “ Boha kráčejícího po tváři země.“Dělá to tím, že zdůrazňuje své božské vlastnosti, které lze vidět v mnoha příbězích evangelií. Jan zobrazuje Ježíšův vztah s Jidášem mnohem jinak než v Markově evangeliu. V Janově evangeliu, Ježíš a jeho učedníci jdou do zahrady, aby se modlili a Jidáš věděl o místě. Ježíš si byl vědom toho, co se bude dít. V Janově evangeliu je Ježíš zobrazen jako mnohem více přijímající svůj osud než v Markově evangeliu. V Markově evangeliu je Ježíš popisován jako zoufalý a rozrušený. Byl hluboce zarmoucen tím, co se bude konat. Když učedníci usnuli, když se Ježíš modlil, Ježíš se na ně rozčílil. V Markově evangeliu je mnohem méně chápavý. Další částí je Ježíšův pochod na místo jeho smrti. V Janově evangeliu Ježíš nesl kříž sám do Golgoty, ale v Markově evangeliu měl Ježíš pomoc od Šimona z Kyrény. Další částí je Ježíš na kříži. V Janovi Ježíš říká, že je hotovo, skloní hlavu a zemře. V Markovi Ježíš volá: „můj Bože, můj Bože, proč jsi mě opustil.“Ježíš nepřijímá svůj osud v Markovi jako v Janovi. Poslední část, na kterou jsem se podíval, je prázdná hrobka. V Janovi, když Marie Magadalene, Šimon Petr, a milovaný žák najít prázdnou hrobku, tam byly úhly sedí v místě, kde Ježíš byl a neměli strach, co viděli. Marka, Marie Magadalene, Marie matka Jamese, a Salome najít prázdnou hrobku. Nikomu neřekli, co viděli, protože se báli.
Johnova verze se více přizpůsobuje žánru starověké biografie, protože Starověká biografie musí obsahovat část o smrti a posmrtném životě. V Janovi, ti, kteří najdou Ježíšovu prázdnou hrobku a kdo se zdá, že se ho Ježíš nebojí, jako to dělají v Markovi. Bylo by mnohem obtížnější přesvědčit lidi o Ježíšově vzkříšení, kdyby se ti, kdo ho viděli, báli.