RECESSIVE defekter
| Gen navn | beskrivelse | Gen & Ekspressionskode |
| BLAD | Bovin Leukocytadhæsionsmangel (mangel på et normalt forekommende protein, der er nødvendigt for hvide blodlegemer eller leukocytter, som er kroppens infektionskæmpere) | BLC = testet bærer af BLAD BLF = testet ikke-bærer af BLAD |
| Muldyrfod | Muldyrfod (tæer af fod er sammenføjet, hvilket giver dyr en enkelt hov i stedet for kløv ones) | MFC = testet bærer af Muldyrfod MFF = testet ikke-bærer af Muldyrfod |
| lossepladser | mangel på Uridinmonophosphatsyntase (en af mange stoffer, der bidrager til normale metaboliske processer) | DPC = testet bærer af lossepladser DPF = testet ikke-bærer af lossepladser |
| CVM | kompleks vertebral misdannelse (forårsager stadig fødte kalve, aborter og tidlige embryonale tab) | CVC = testet bærer af CVM CVF = testet ikke-bærer af CVM |
| faktor 1 | Faktor 1 (blodkoagulationsforstyrrelse) | HIC = testet bærer af faktor 1 HIF = testet ikke-bærer af faktor 1 |
| CIT | Citrullinæmi (akkumulering af ammoniak og andre toksiske stoffer i blod hos unge kalve) | CNC = testet bærer af Citrullinæmi CNF = testet ikke-bærer af Citrullinæmi |
| Brachyspina | Brachyspina (forårsager abort og dødfødt, forkortet rygmarv, lange ben og unormale organer) | BYC = testet bærer af Brachyspina BYF = testet ikke-bærer af Brachyspina |
| CD (direkte test) | Kolesterolmangel , kalve har reduceret eller intet kolesterol, hvilket resulterer i død i en ung alder | CDF = testet ikke-bærer / fri for kolesterolmangel CDC = testet bærer af kolesterolmangel (heterosygøs) CDS = testet ægte bærer af kolesterolmangel (homosygøs)) |
POLLED STATUS
| Polled Status | Gen | Gen & Ekspressionskode |
| Polled (nuværende indirekte Test) | indirekte Test | POS= testet ægte pollet (homosygøs PP) POC = testet bærer af pollet (heterosygøs Pp) POF= testet fri for pollet |
røde alleler
| pelsfarve | Gen | Gen & Ekspressionskode |
| rød | rødt gen(MCR1) | RDC = bærer af rødt gen RDF = testet ikke-bærer af rødt gen |
| rød | Variant rødt gen | VRR = ikke testet/bestemt af afstamning. VRS = testet sand (homosygøs) * inkluderer BKC-kode. VRC = testet bærer (heterosygøs) VRF = testet gratis. |
| sort / rød | sort / rødt gen (MCR1) | BRC = bærer af sort / rødt gen |
| sort | Sort gen (MCR1) | BKC = bærer af sort gen |
mælkeproteiner
| mælkeproteiner | Gen | Gen & Ekspressionskode |
| Betakasein (A2) | CSN2 | A1A1 = homosygøs for A1-allelen a1a2 = heterosygøs for A1 og A2 A2A2 = homosygøs for A2 |
| Kappa-kasein | CSN2 | KCAA = homosygøs for a-allelen KCAB = heterosygøs for a & B KCBB = homosygøs for B KCAC = heterosygøs for a & C KCAE = heterosygøs for a & e |
haplotyper, der påvirker embryonets fertilitet
seks defekte haplotyper, identificeret ved genomisk test, vides at have negativ indflydelse på fertiliteten hos Holstein-racen. Disse er HH1, HH2, HH3, HH4, HH5 og HH6. Tilsvarende er JH1 haplotype rapporteret Jersey racen, som er BH2 i brun Svejts og AH1 og AH2 i Ayrshires.
årsagerne til, at haplotyper påvirker fertiliteten, er ukendte, men det antages, at arv af den samme defekte haplotype fra hver forælder resulterer i mislykket undfangelse eller tidlig embryonal død.
dyr, der bærer en version af en defekt haplotype, er kodet med en C. For eksempel er et dyr, der bærer HH1, kodet HH1C. dyr, der er identificeret som uden kopier (dvs. fri for haplotypen), kodes med en T, for eksempel HH1T.
haplotype arv
1. Hvis begge forældre er bærere af en uønsket haplotype (HH1C):
der er en 25% chance for, at der vil være et påvirket afkom, der ikke ville overleve til fødslen
af det levende afkom, en tredjedel vil være upåvirket ikke-bærere og to tredjedele vil være bærere, for eksempel: Hh1c Ko (bærer = Rr) hh1c Ko (bærer = Rr) R = Normal haplotype
r = HH1 Haplotype (indeholdende den forårsagende mutation)
2. Hvis dæmningen er ukendt, men bedstefar og tyr begge er upåvirkede bærere af en uønsket haplotype (HH1C): der er en 12,5% chance for, at det resulterende embryo ikke overlever til fødslen
3. Hvis koen og Tyren var bærere af forskellige haplotyper, f.eks. hvis koen var HH1C og Tyren var HH2C, kunne følgende resulterende afkom forventes:
– 25% ikke-bærere af begge (HH1T og HH2T) )
– 25% bærere af den ene (HH1C)
– 25% bærere af den anden (HH2C)
– 25% bærere af begge (hh1c)
– 25% bærere af den anden (HH2C)
– 25% bærere af begge (hh1c)
AVLSBESLUTNINGER og FERTILITETSHAPLOTYPER
det bedste råd er at undgå at bruge tyre, der bærer nogen af disse defekte haplotyper, da brug af sådanne far vil reducere BEFRUGTNINGSGRADEN i den gennemsnitlige besætning. Hvis hunnerne, der parres, også er blevet genomisk testet, kan en bærertyr bruges, hvis hunnen er en ikke-bærer. Opdrættere ønsker dog muligvis ikke at risikere at producere en bærekalv, som kan have en lavere økonomisk værdi til avl, for eksempel hvis det var en AI-kandidat tyr.