alligatoren tilpasser sig sit miljø ved at stole på dets camouflerede hud, placeringen af dets Øjne og næsebor, ørernes evne til at lukke og dets specialiserede organer. Både alligatorens lunger og hjerte er tilpasset lange perioder brugt nedsænket i vandet.
en af alligatorens tilpasninger til sit miljø ligger i de specialiserede lunger og hjerte, der gør det muligt at forblive sikkert nedsænket i vandet. Lungerne er beskyttet af en struktur, der forhindrer vand i at komme ind i dem, selv mens munden er åben. Hjertet er i stand til at adskille iltet og iltet blod og sende det iltrige blod til hjernen, så alligatoren kan forblive under vand i lange perioder.
alligatorens øjne, næse og ører er også tilpasset dets vandige miljø. Både næseborene og øjnene er placeret oven på hovedet, så det kan forblive næsten helt nedsænket og stadig trække vejret gennem næseborene. Når øjnene er nedsænket, beskytter en membran dem og gør det muligt for alligatoren at se.
en anden tilpasning er alligatorens skjul. Den grå farve og drejeknapper og buler på kroppen gør det muligt at blande sig med omgivelserne, hvilket ofte giver alligatoren udseendet af en log og giver den mulighed for at snige sig på bytte.