ANOMALIES RÉCESSIVES
| Nom du gène | Description | Code d’expression du gène & |
| BLAD | Déficit d’adhésion des leucocytes bovins (déficit d’une protéine normalement nécessaire aux globules blancs ou aux leucocytes, qui sont les combattants de l’infection de l’organisme) | BLC = porteur testé de BLAD BLF = non porteur testé de BLAD |
| Pied de mulet | Pied de mulet (les orteils du pied sont joints, donnant à l’animal un seul sabot, au lieu d’être fendus | MFC = support testé du pied de mule MFF = non-support testé du pied de mule |
| DÉCHARGES | Carence en Uridine Monophosphate Synthase (l’une des nombreuses enzymes contribuant aux processus métaboliques normaux) | DPC = porteur testé des DÉCHARGES DPF = non porteur testé des DÉCHARGES |
| CVM | Malformation vertébrale complexe (provoque des veaux mort-nés, des avortements et des pertes embryonnaires précoces) | CVC = porteur testé de CVM CVF = non porteur testé de CVM |
| Facteur X1 | Facteur X1 (trouble de la coagulation sanguine) | XIC = porteur testé du facteur X1 XIF = non porteur testé du facteur X1 |
| CIT | Citrullinémie (accumulation d’ammoniac et d’autres substances toxiques dans le sang chez les jeunes veaux) | CNC = porteur testé de citrullinémie CNF = non porteur testé de citrullinémie |
| Brachyspina | Brachyspina (provoque un avortement et un mort-né, une moelle épinière raccourcie, de longues jambes et des organes anormaux) | BYC = porteur testé de Brachyspina BYF = non porteur testé de Brachyspina |
| CD (test direct) | Déficit en cholestérol, les veaux ont un taux de cholestérol réduit ou nul entraînant la mort à un jeune âge | CDF = testé non porteur / exempt de déficit en cholestérol CDC = porteur testé de déficit en cholestérol (hétérozygote) CDS = véritable porteur testé de déficit en cholestérol (homozygote) |
STATUT DES SONDÉS
| Statut interrogé | Gène | Gène & Code d’expression |
| Sondé (Test indirect actuel) | Test indirect | POS = testé vrai sondé (PP homozygote) POC = porteur testé de sondé (Pp hétérozygote) POF = testé exempt de sondé |
ALLÈLES ROUGES
| Couleur du pelage | Gène | Gène & Code d’expression |
| ROUGE | Gène rouge (MCR1) | RDC = porteur du gène rouge RDF = non porteur testé du gène rouge |
| Gène ROUGE | Variante du gène rouge | VRR = non testé / déterminé par lignée. VRS = testé vrai (homozygote) * Inclut le code BKC. VRC = porteur testé (hétérozygote) VRF = testé libre. |
| Gène NOIR/ROUGE | Gène noir/rouge (MCR1) | BRC = porteur du gène noir/rouge |
| Gène noir | Gène noir (MCR1) | BKC = porteur du gène noir |
PROTÉINES DE LAIT
| Protéines du lait | Gène | Gène & Code d’expression |
| Caséine bêta (A2) | CSN2 | A1A1 = homozygote pour l’allèle A1 A1A2 = hétérozygote pour A1 ET A2 A2A2 = homozygote pour A2 |
| Caséine Kappa | CSN2 | KCAA = homozygote pour l’allèle A KCAB = hétérozygote pour A & B KCBB = homozygote pour B KCAC = hétérozygote pour A & C KCAE = hétérozygote pour A & E |
HAPLOTYPES AFFECTANT LA FERTILITÉ EMBRYONNAIRE
Six haplotypes défectueux, identifiés par des tests génomiques, sont connus pour avoir un impact négatif sur la fertilité de la race Holstein. Ce sont HH1, HH2, HH3, HH4, HH5 et HH6. De même, l’haplotype JH1 est signalé comme la race Jersey, tout comme BH2 chez le Suisse brun et AH1 et AH2 chez les Ayrshires.
Les raisons pour lesquelles les haplotypes ont un impact sur la fertilité sont inconnues, mais on pense que l’héritage du même haplotype défectueux de chaque parent entraîne un échec de la conception ou une mort embryonnaire précoce.
Les animaux portant une version d’un haplotype défectueux sont codés avec un C. Par example, un animal portant HH1 est codé HH1C. Les animaux identifiés comme n’ayant pas de copies (c’est-à-dire libres de l’haplotype) sont codés avec un T, par example HH1T.
HÉRITAGE D’HAPLOTYPE
1. Si les deux parents sont porteurs d’un haplotype indésirable (HH1C):
Il y a 25% de chances qu’il y ait une progéniture affectée qui ne survivrait pas à la naissance
De la progéniture vivante, un tiers sera non-porteur non affecté et les deux tiers seront porteurs, par exemple: Vache HH1C (porteuse = Rr) x Vache HH1C (porteuse = Rr) R = haplotype normal
r = Haplotype HH1 (contenant la mutation causale)
2. Si la mère est inconnue, mais que le grand-père et le taureau sont tous deux porteurs non affectés d’un haplotype indésirable (HH1C): Il y a 12,5% de chances que l’embryon résultant ne survive pas à la naissance
3. Si la vache et le taureau étaient porteurs d’haplotypes différents, par exemple si la vache était HH1C et le taureau était HH2C, on pouvait s’attendre à ce que la progéniture résultante suivante:
– 25% de non-porteurs des deux (HH1T et HH2T))
– 25% de porteurs de l’un (HH1C)
– 25% de porteurs de l’autre (HH2C)
– 25% de porteurs des deux (HH1C) HH1C et HH2C)
DÉCISIONS D’ÉLEVAGE ET HAPLOTYPES DE FERTILITÉ
Le meilleur conseil est d’éviter d’utiliser des taureaux porteurs de l’un de ces haplotypes défectueux, car l’utilisation de tels taureaux réduira les taux de conception dans le troupeau moyen. Si les femelles accouplées ont également fait l’objet de tests génomiques, un taureau porteur peut être utilisé si la femelle n’est pas porteuse. Cependant, les éleveurs peuvent ne pas vouloir prendre le risque de produire un veau porteur, qui peut avoir une valeur financière plus faible pour la reproduction, par exemple s’il s’agissait d’un taureau candidat à l’IA.