長期的に持続可能性。 環境で観察される多くの変化は長期的であり、時間の経過とともにゆっくりと起こる。 有機農業は、農業介入が農業生態系に及ぼす中長期的な影響を考慮している。 土壌の肥沃度や害虫の問題を防ぐために生態学的バランスを確立しながら食品を生産することを目指しています。 有機農業は、問題が発生した後に問題を治療するのではなく、積極的なアプローチを取ります。
作物の回転、間作、共生協会、カバー作物、有機肥料、最小耕作などの土壌構築慣行は、有機慣行の中心です。 これらは、土壌の動植物を奨励し、土壌の形成と構造を改善し、より安定したシステムを作成します。 次に、栄養素とエネルギーの循環が増加し、栄養素と水のための土壌の保持能力が強化され、ミネラル肥料の不使用を補う。 このような管理技術は、土壌侵食制御においても重要な役割を果たす。 土壌が侵食力にさらされる時間の長さが減少し、土壌の生物多様性が増加し、栄養損失が減少し、土壌の生産性を維持し、向上させるのに役立ちます。 栄養素の作物の輸出は、通常、農場由来の再生可能資源によって補償されますが、外部ソースからのカリウム、リン酸塩、カルシウム、マグネシウム、微量元素で有機土壌を補うことが必要な場合があります。
多くの農業分野では、合成肥料や農薬による地下水コースの汚染が大きな問題です。 有機農業ではこれらの使用が禁止されているため、有機肥料（堆肥、動物肥料、緑肥など）に置き換えられ、より大きな生物多様性（栽培種と恒久的な植生の面で）を使用して土壌構造と水の浸透を促進する。 よりよい栄養保持能力のよく管理された有機性システムは、地下水汚染の危険を非常に減らします。 汚染が本当の問題であるいくつかの地域では、有機農業への転換は修復措置として非常に奨励されています（例えば、フランスとドイツの政府）。
空気と気候変動。 有機農業は、農薬の必要性を減らすことによって非再生可能エネルギーの使用を削減します（これらは大量の化石燃料を生産する必要があります）。 有機農業は、土壌中の炭素を隔離する能力を通じて、温室効果と地球温暖化の緩和に貢献しています。 有機農業で使用される多くの管理慣行（例えば 最低の耕作、土への穀物の残余を戻すこと、カバー穀物および回転の使用、および窒素固定マメ科植物のより大きい統合）、土へのカーボンのリターンを高め、生産性を上げ、カーボン貯蔵を支持する。 多くの研究により、有機農業下の土壌有機炭素contents有量はかなり高いことが明らかになった。 有機炭素が土壌中に保持されるほど、気候変動に対する農業の緩和の可能性が高くなります。 しかし、まだ、この分野で必要な多くの研究があります。 開発途上国の土壌有機炭素に関するデータが不足しており、アフリカとラテンアメリカの農業システム比較データはなく、農業慣行の炭素隔離率を決定するために重要な土壌有機炭素ストックに関するデータは限られている。
有機農家は、すべてのレベルで生物多様性の管理人とユーザーの両方です。 遺伝子レベルでは、伝統的で適応した種子および品種は、病気に対するより大きな抵抗性および気候ストレスに対する回復力のために好まれる。 種レベルでは、植物と動物の多様な組み合わせは、農業生産のための栄養とエネルギー循環を最適化します。 生態系レベルでは、有機畑内およびその周辺の自然地域の維持と化学物質の入力の欠如は、野生生物に適した生息地を作り出します。 利用されていない種（しばしば土壌肥沃度を構築するための回転作物として）の頻繁な使用は、農業生物多様性の侵食を減少させ、将来の適応の基礎 食糧と避難所を提供する構造の提供、および農薬の使用の欠如は、野生の動植物（例えば鳥）および花粉媒介者および害虫捕食者のような有機系に有益な生物を含む、有機地域（永久的および渡り鳥の両方）に新しいまたは再植民地化種を引き付ける。 有機農業と生物多様性に関する研究の数は、ここ数年で大幅に増加しました。 766の科学論文のメタ分析に関する最近の研究では、有機農業は他の農業システムよりも多くの生物多様性を生み出すと結論づけられています。
有機システム内でのGmoの使用は、有機食品の生産、加工または取り扱いのいずれの段階でも許可されていません。 環境と健康の両方へのGmoの潜在的な影響が完全に理解されていないため、有機農業は予防的アプローチをとり、自然の生物多様性を奨励することを選 従って有機性ラベルはGmoが有機性プロダクトの生産そして処理で意図的に使用されなかったという保証を提供する。 これは、食品中のGmoの存在をラベル付けすることはまだほとんどの国で発効していないため、従来の製品では保証できないものです。 しかし、従来の農業におけるGMOの使用の増加と、環境中でのGmoの伝達方法（花粉など）のために、有機農業は、有機製品が将来完全にGMOフリーであることを確 Gmoに関する詳細な議論は、FAOの出版物”遺伝子組み換え生物、消費者、食品の安全性と環境”に記載されています。
有機農業が天然資源に及ぼす影響は、農業生産と自然保護の両方に不可欠な農業生態系内の相互作用を支持しています。 得られた生態学的サービスには、土壌の形成と調節、土壌の安定化、廃棄物のリサイクル、炭素隔離、栄養素の循環、捕食、受粉および生息地が含まれる。 有機製品を選ぶことによって、消費者は購買力を介して汚染の少ない農業システムを促進します。 天然資源の劣化の面で環境への農業の隠されたコストが削減されます。